Bereits seit mehreren Jahren leitet der aktuelle Vorstand die Geschicke des Vereins. Präsident des SC Naumburg ist Lars Frohn, weiterhin gehören dazu: Stefan Rupp, Maik Lehner, Thomas Ruppe, Heiko Müller und Paul Plobner.
Gemeinsam treffen sie wichtige sportliche sowie finanzielle und viele andere essenzielle Entscheidungen. Wichtig ist ihnen der Dialog mit Trainern, Spielern und Unterstützern des Vereins.